1、2004年，南菁中学高考成绩平均分615分，无锡第一，数理化历史地理等多门课程平均分位居无锡第一，包揽了清华大学在江阴的全部录取名额，有8人录取清华北大，刘千昱、赵建新分别获得我市高考的第一第二名并获得戚维駿奖学金。南菁物理竞赛一等奖人数全省第二，王强闯进全国冬令营并获银奖。
2、2004年7月，校长、校党委书记夏锡良被评为全国教育系统先进教育工作者。
3、南菁国家级科研课题《南菁文化发展研究》的研究工作全面展开。12月28日，面向全省举行了“南菁文化发展研究第三次课堂教学展示活动”。
4、课程改革进展顺利。2004年秋季学期开始，南菁中学语文学科率先在全省采用新课程标准教材，从而揭开南菁中学实施新课程改革的序幕。11月份，南菁中学承办的“全国大中小学学习改革与学习指导一体化”教育研讨会，学校新课程改革阶段性成果在全国展示。
5、学校现代化教育水平不断提高。南菁中学一线教师已经实现人手配备一台笔记本电脑，每个教室都安装了多媒体设备，校园网连通全世界，学校数字化建设水平和现代教育技术水平处于全省前列。
6、4月，首届教职工体育节开幕，受到教职员工的欢迎；12月，学校成功承办无锡重点中学乒乓球比赛，并夺得团体冠军
7、5月，一年一度的校园文化艺术节在继承传统的基础上，不断丰富新的内涵。博士讲座让学生在校园里就可以感受到现代科学前进的脚步；菁园文化一条街让学生充分领略到市场经济下诚信与竞争的重要，充分感受到社会的脉搏。
9、江阴教育学会物理专业委员会第六届年会11月21日在南菁开幕，夏锡良同志被推选为新一届理事长；无锡语言学会第18届年会在南菁举行，党委副书记、副校长过建春在本届年会上当选为副会长。
10、成功地接待国际友好学校德国圣布拉辛学校的师生代表团，并实现了对英国、德国的友好访问。
11、月底，校长夏锡良同志还会见了加拿大多伦多大学的学者，就两校合作办学达成初步共识。
12、信联教师奖励基金设立，南菁校友许铭一次性出资100万元，首批10名教师各获5000元奖励。
13、2004年8月，南菁2000届校友，清华大学电子工程系学生夏添以优异成绩考取美国普林斯顿大学攻读硕博学位。此前，他收到了华裔诺贝尔物理学奖获得者崔奇教授的亲笔信，并获得美国国家全额奖学金的资助（每年六万美金，共5年，全球每年有8人得此项奖学金）。
14、5月，南菁中学邀请省教育教育评估院院长杨晓江博士、教育评估院副院长、联合国教科文组织亚太教育委员会委员袁益民教授来校作五星级学校创建的专题讲座。
15、12月，南菁中学档案室被江苏省档案局授予一级档案室，目前，无锡市中学仅此一家。
