1、3月，复旦大学在江苏省20所重点中学举行提前招生考试，南菁6名学生参加考试，4名被提前录取，考试总分、录取率均居全省第一。
2、4月，非典期间，德国圣布拉辛中学校长西普纳先生来访。
3、5月，“华东师大教学实践基地”挂牌，南菁与重点高校合作进一步加强。
4、7月，南菁与华东师大合作举办的“教学与课程论”研究生班开学，40名老师接受新课程与现代教育理念的培训。
5、8月，高考成绩喜人。全市文理状元及前十名均在南菁，有8人被清华大学录取。
6、9月，南菁东校区正式启用，初中恢复招生，南菁开始一校两区的发展阶段。
7、10月，2003年我校奥赛再获丰收，其中物理有9 人获一等奖（无锡共10人），数学有4人获一等奖，学科竞赛继续全省领先。
8、10月，全国德育工作年会现场会在我校召开，高度评价我校德育工作。
9、11月，经党支部推荐，党委批准，南菁中学完成文科、理科、后勤党支部组成人员地换届。徐国昌、陈国龙、赵长缨分别任支部书记。
10、12月，我校第六届教职工代表大会召开，选举产生了新一届工会委员会，过建春副校长任工会主席，通过了《关于创建五星级学校的规划设想》，对南菁未来发展作出了战略性部署。
